кДНК — ГИБРИДИЗАЦИЯ
(cDNA hybridization)
- метод обнаружения нуклеиновых кислот с помощью гибридизационных зондов. Химической основой метода является соединение искомой нуклеиновой кислоты с меченым зондом через комплементарные ДНК-ДНК участки; исход их взаимодействия учитывается по появлению метки (обычно радиоизотопной) в составе образовавшегося комплекса. Постановка кДНК — гибридизации предполагает:
- экстракцию и денатурирование нуклеиновой кислоты;
- инкубацию ее в растворе с избытком молекул зонда в режимах, специально подобранных для каждой конкретной гибридизации (в конечном счете они определяются степенью комплементарности реагирующих участков);
- отмывание комплекса от несвязавшихся молекул зонда; и
- учет результатов по интенсивности сигнала, поступающего от метки в составе комплекса. Чаще всего применяют т.н. точечную (dot-blot) гибридизацию на мембранных фильтрах.
В работе с вирусами гепатитов кДНК-гибридизация позволяет обнаруживать частицы, содержащие полномерную нуклеиновую кислоту или ее фрагменты с последовательностями, комплементарными имеющимся зондам. Чувствительность ее, как правило, на 1—2 порядка выше, чем у твердофазных серологических тестов. В качестве примера можно указать на успешное применение данного метода для обнаружения частиц Дейна в крови и биоптатах печени при подозрении на инфекцию гепатита В или поиск вируса гепатита А в экскретах больного и объектах внешней среды. кДНК — гибридизация является одним из основных методов в работах по генной инженерии. С ее помощью, в частности, осуществляется отбор клонов микроорганизмов, несущих встроенные нуклеотидные последовательности.